L'île de Comino se caractérise par une activité humaine relativement localisée.
L'avifaune de l'île est très pauvre en espèces, alors que l'herpétofaune se distinguepar sa richesse en particulier, à travers d'importantes populations de Podarcisfilfolensis et de Chalcides ocellatus tiligu.
D'autre part, cette île abrite une importante population de lapins de garennesOrychtolagus cuniculus, de souris grises Mus musculus et surtout une population de rats noirs Rattus rattus, dont on ignore l'abondance et les réels impacts de sa présence sur l'écosystème de Comino. Les menaces potentielles des ces trois mammifères allochtones et notamment le rat noir, demeurent pesantes et ceci en raison de la mauvaise réputation de ces trois espèces et de leur impact négatif sur lefonctionnement des écosystèmes d'accueil, particulièrement dans le cas desécosystèmes insulaires.
Il convient cependant de relativiser l'action d'élimination de ces rongeurs etparticulièrement celle de l'éradication du rat noir, vu l'absence de réelles mesures del'impact de leur présence sur la faune et la flore de cette île et notamment avec uneavifaune quasi-absente, une herpétofaune en abondance et une florecaractéristique (garrigue) qui semble être en bon état de conservation.
Toutefois, l'option de l'éradication de la population de rats noirs de Comino estréalisable, malgré sa grande superficie (> à 100 ha) et ses formationsgéomorphologiques qui en rendent l'accès difficile (falaises, substrat calcairediaclasé, formations karstiques, grottes etc...) qui compliquent la mise en oe uvre decette action.